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Isomorphic Labs
Overview
Isomorphic Labs 是从 Google DeepMind 分拄出来的 AI 药物发现公司，由 Demis Hassabis 创立，总部位于英国伦敦。公司的使命是"用 AI 解决所有疾病"，基于诺贝尔奖得主 AlphaFold 系统，构建更强大的预测和生成式 AI 模型以加速科学发现。
Isomorphic Labs 代表了 AI 在药物发现领域的最前沿——将结构预测的突破性进展转化为实际的药物设计能力。
核心团队
| 成员 | 背景 |
|---|---|
| Demis Hassabis | 创始人、CEO；DeepMind 联合创始人；2024 年诺贝尔化学奖得主 |
| Max Jaderberg | 总裁；原 DeepMind 科学家，计算机视觉和深度学习专家 |
| 跨学科团队 | 药物发现专家 + 机器学习专家的结合 |
技术平台
IsoDDE（Isomorphic Labs Drug Design Engine）
IsoDDE 是一个统一的计算药物设计系统，在 AlphaFold 3 基础上实现了重大突破：
1. 蛋白质-配体结构预测
- 在最困难的泛化测试上，准确性超过 AlphaFold 3 两倍以上
- 能够建模诱导符合（induced fit）和隐藏口袋（cryptic pockets）等复杂生物机制
- 适用于训练集之外的新颖系统
2. 抗体-抗原结构预测
- 在高保真度区域（DockQ > 0.8），表现超过 AlphaFold 3 2.3 倍
- 超过 Boltz-2 19.8 倍
- 在最变异的 CDR-H3 环区域表现突出
- 解锁了 de novo 抗体设计的可能性
3. 结合能力预测
- 在三个公开基准测试中超越所有深度学习方法
- 超越金标准物理方法（如 FEP）的准确性
- 不需要实验晶体结构作为输入
- 在几秒内完成计算，而不是物理方法的数天
4. 盲目口袋识别
- 仅使用氨基酸序列作为输入，无需已知配体
- 能够发现新的、可配位的口袋
- 在 cereblon 蛋白上成功预测了最近实验发现的隐藏口袋
- 性能接近实验技术（fragment soaking），但在几秒内完成
与 AlphaFold 的关系
| 维度 | AlphaFold 3 | IsoDDE |
|---|---|---|
| 核心能力 | 结构预测 | 结构预测 + 药物设计 |
| 蛋白-配体 | 基准水平 | 泛化性提升 2x+ |
| 抗体-抗原 | 基准水平 | 高保真度区 2.3x |
| 结合能力 | 不支持 | 超越物理方法 |
| 口袋发现 | 需要配体 | 无配体盲目识别 |
| 实际药物发现 | 间接支持 | 直接设计能力 |
战略合作
| 合作伙伴 | 合作内容 |
|---|---|
| Johnson & Johnson | 研究合作，共同开发新药 |
| Google DeepMind | 技术合作与协同，AlphaFold 技术的延续 |
为什么重要
- Isomorphic Labs 是将获得诺贝尔奖的 AlphaFold 研究转化为商业药物发现能力的关键桥梁
- IsoDDE 展示了 AI 在药物设计中从"结构预测"走向"结合能力预测"和"分子设计"的跨越
- 其"无需实验结构"的预测能力可能彻底改变药物发现的时间和成本结构
- 代表了 AI 科学研究与工业应用的最高水平融合
相关实体
Google DeepMind — AlphaFold 的创造者，Isomorphic Labs 的技术源头
Recursion — AI 驱动的药物发现平台
OpenEvidence — 医疗决策支持 AI 平台
Aidoc — 临床影像 AI 先驱
Recursion — AI 生物技术